26 июля 2021 года Арбитражный суд города Москвы отказал в удовлетворении заявления АО «Авиакомпания «Якутия» о признании незаконным действий Федеральной службы по надзору в сфере транспорта.

В феврале 2021 года Ространснадзором выдано предписание об устранении многочисленных нарушений  связанных с технической эксплуатацией 4-х воздушных судов Boeing 737 АО «Авиакомпания «Якутия», зарегистрированных на Бермудах.

Также в ходе судебного процесса АО «Авиакомпания «Якутия» оспаривало факт наличия у Федеральной службы по надзору в сфере транспорта полномочий по проверке технического состояния воздушных судов офшорных регистраций, эксплуатируемых российскими авиаперевозчиками, и право Ространснадзора запрещать эксплуатацию воздушных судов. Данные доводы авиакомпании Арбитражный суд города Москвы не поддержал.