Федеральная служба по надзору в сфере транспорта осуществляет свою деятельность по достижению национальных целей развития в соответствии с указами Президента РФ от 7 мая 2018 года № 204 «О национальных целях и стратегических задачах развития Российской Федерации на период до 2024 года», от 7 мая 2024 года № 309 «О национальных целях развития РФ до 2030 года и на перспективу до 2036 года» и Единым планом по достижению национальных целей развития Российской Федерации до 2030 года и на перспективу до 2036 года. 

Деятельность Федеральной службы по надзору в сфере транспорта влияет на достижение 3 национальных целей и 9 показателей, утвержденных Указом Президента Российской Федерации от 7 мая 2024 года № 309:

1) Сохранение населения, укрепление здоровья и повышение благополучия людей, поддержка семьи:

• увеличение ожидаемой продолжительности жизни до 78 лет к 2030 году и до 81 года к 2036 году, в том числе опережающий рост показателей ожидаемой продолжительности здоровой жизни.

2) Комфортная и безопасная среда для жизни:

• снижение смертности в результате дорожно-транспортных происшествий в полтора раза к 2030 году и в два раза к 2036 году по сравнению с показателем 2023 года.

3) Цифровая трансформация государственного и муниципального управления, экономики и социальной сферы:

• достижение к 2030 году «цифровой зрелости» государственного и муниципального управления, ключевых отраслей экономики и социальной сферы, в том числе здравоохранения и образования, предполагающей автоматизацию большей части транзакций в рамках единых отраслевых цифровых платформ и модели управления на основе данных с учетом ускоренного внедрения технологий обработки больших объемов данных, машинного обучения и искусственного интеллекта;
• обеспечение в 2025-2030 годах темпа роста инвестиций в отечественные решения в сфере информационных технологий вдвое выше темпа роста валового внутреннего продукта;
• увеличение к 2030 году до 95 процентов доли использования российского программного обеспечения в государственных органах, государственных корпорациях, государственных компаниях и хозяйственных обществах, в уставном капитале которых доля участия Российской Федерации в совокупности превышает 50 процентов, а также в их аффилированных юридических лицах;
• переход к 2030 году не менее 80 процентов российских организаций ключевых отраслей экономики на использование базового и прикладного российского программного обеспечения в системах, обеспечивающих основные производственные и управленческие процессы;
• увеличение к 2030 году до 99 процентов доли предоставления массовых социально значимых государственных и муниципальных услуг в электронной форме, в том числе внедрение системы поддержки принятия решений в рамках предоставления не менее чем 100 массовых социально значимых государственных услуг в электронной форме в проактивном режиме или при непосредственном обращении заявителя, за счет внедрения в деятельность органов государственной власти единой цифровой платформы; 
• создание системы эффективного противодействия преступлениям, совершаемым с использованием информационно-телекоммуникационных технологий, и снижения ущерба от их совершения;
• обеспечение сетевого суверенитета и информационной безопасности в информационно-телекоммуникационной сети «Интернет».

Инструментами достижения национальных целей развития являются:

• ведомственный проект «Совершенствование контрольно-надзорной деятельности в сфере транспорта Российской Федерации». Ключевой показатель «Снижение количества смертельных случаев  и случаев травматизма» влияет на достижение целей развития Российской Федерации на период до 2030 года и на перспективу до 2036 года «Сохранение населения, укрепление здоровья и повышение благополучия людей, поддержка семьи» и «Комфортная и безопасная среда для жизни» и соответствующих показателей по повышению уровня ожидаемой продолжительности жизни населения и снижению смертности в результате дорожно-транспортных происшествий;
• ведомственная программа цифровой трансформации Федеральной службы по надзору в сфере транспорта. Показатели программы влияют на достижение цели развития России на период до 2030 года и на перспективу до 2036 года «Цифровая трансформация государственного и муниципального управления, экономики и социальной сферы» и соответствующих ей показателей.

Инструментом реализации стратегических целей являются ежегодно утверждаемые публичные декларации ключевых целей и задач Федеральной службы по надзору в сфере транспорта.